Sistém
Dříve
Krytosemenné jsou monofyletická skupina
Zatímco jednoděložné jsou charakterizovány jedinou dělohou, adventivním kořenovým systémem v důsledku brzkého zániku radikuly, stonky s roztroušenými cévními svazky, absencí sekundárního růstu, listy s paralelní žilnatinou, trojčetnými květy a pylovými zrny obvykle monosulkátními, dvouděložné mají kořenový systém s hlavním kořenem, stonky s cévními svazky v kruhu a často se druhotným tloustnutím, listy se zpeřenou nebo dlanitou žilnatinou a pylovými zrny alespoň primárně trikolpátními.
Dnes
S nástupem molekulárních analýz jaderné, mitochondriální a plastidové DNA se ukázalo, že třída dvouděložné ve stávajícím pojetí tvoří parafyletickou skupinu, tedy skupinu nezahrnující všechny potomky společného předka. Dnešní mezinárodní kód botanické nomenklatury, postavený na kladistické klasifikaci, však používání nemonofyletických (parafyletických a polyfyletických) taxonů neumožňuje. Proto byl systém rozšířen na tři třídy:
- Liliopsida - jednoděložné
- Magnoliopsida - nižší dvouděložné
- Rosopsida - vyšší dvouděložné
Monofyletickou skupinou jsou v rámci dvouděložných tzv. vyšší dvouděložné (Eudicots, třída Rosopsida). Jejich hlavním synapomorfním znakem je trikolpátní pyl. Zbývající parafyletická skupina dvouděložných, označovaná jako nižší dvouděložné, představuje skupinu 5 starobylých vývojových větví - Amborellales, leknínotvaré ,růžkatcotvaré a větev označovanou v APG systému jako Magnoliids a zahrnující řády vavřínotvaré,šácholanotvaré a pepřotvaré. Používaná třída nižší dvouděložné neboli Magnoliopsida, označující tuto skupinu vývojových větví, není v souladu s mezinárodními pravidly botanické nomenklatury.